“巴斯德研究所：法国疫情由当地不明毒株引起”

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4月28日，法国巴斯德研究所发布软文公告，该所完成了“法国输入性和早期传播病毒朔源分解”的相关研究，结果于近期以预发布形式在biorxiv网站上发表。 根据这项研究，法国暴发的新冠肺炎疫情，不是1月份由中国来的输入病例引起的，也不是来自意大利，而是来自当地流传的来源不明的毒株。 该研究由法国国家呼吸道感染病毒参考中心主任西尔维·范德维尔和巴斯德研究所rna病毒进化基因组学负责人埃迪·西蒙·罗列共同主导。

法国新冠引起肺炎样本一核酸多态性发生部位比较图。 图片来源:巴斯德研究所论文截图

根据巴斯德研究所提供的信息稿，法国于1月10日开始病毒监测，巴斯德研究所和法国呼吸病毒研究所( nrc )开始了密切的关注进程。 法国于1月24日发现首例新型冠状病毒感染者，这也是欧洲首例新冠引起的肺炎患者，另外2例中国输入性患者也很快被检出并治疗。 法国政府迅速采取措施，跟踪这些患者的密切接触者，阻止病毒的进一步传播。 1月份的中国输入病例没有在法国引起局部传递，表明了法国采取病毒防扩散系列措施的比较有效性。

法国采集的新型冠状病毒样本全部保存在国家呼吸病毒研究所，巴斯德研究所rna病毒进化基因研究组对法国97份病毒样本进行了基因序列分析和比对。 样品为鼻咽拭子和痰液，采样时间为1月24日至3月24日。 法国这一阶段确诊病例为22302人，死亡1100人，疫情在法国北部最为流行。 所有样本均取自有临床症状的确诊患者，将籍贯、旅行经历、发病时间、病毒量和采样位点纳入基因拷贝。 有三个来自阿尔及利亚的病毒样本。

欧洲精准医疗平台首席科学家玛丽亚解读称，采自法国东南部，拥有意大利旅游史的病毒株( ge1583，b2340 )与法国北部不同，但与意大利北部流行株相似，并未在法国流行。 法国首个来自中国的确诊患者( idf0372 )，单核苷酸多态性g22661t独特，与法国所有病毒基因不同的法国北部地区的代表性病毒基因为ge1973 (东大地区)、idf2849 (巴黎地区)、n2223。 来自阿尔及利亚的病毒株3株与法国北部的流行株同源。

巴斯德研究所将在法国检测到的样本序列与世界共有流感数据提案组织( gisaid )发表的338个新冠的肺炎病毒序列进行比对，进行跟踪分析，制作出病毒的进化树图像。 研究表明，法国流行的新型冠状病毒和1月发现的中国进口感染病毒不是来自同一个病毒株，两种病毒来自同一个“祖先”，但属于不同的分支。 法国当地疫情的主流分支与来自中国和意大利的输入病例各不相同。 法国目前流行的病毒样本中，最初的样本是2月19日从患者身上采集的，国内外旅行经历和海外归国旅客都没有接触过。 该患者于2月25日去世，之后法国发生了大规模疫情。

鞠丽雅对科技日报记者说，来自亚太地区(包括湖北武汉)的病毒株与法国病毒株无关。 来自美国的病毒株与法国的关联很小。 法国北部的流行病毒株都来自同一个原始株。 通俗地说，法国新型冠状病毒是一个历史悠久的大家庭，与中国武汉的病例相去甚远。

综合这些结果，巴斯德研究小组认为，最具代表性的基因型首发病例没有旅行史，因此在2月欧洲疫情爆发前，病毒已经“悄悄地”在法国和欧洲其他国家流行，且大部分为轻症或无症状 这项工作为法国的病毒追踪提供了线索，强调在无症状病例大量存在的情况下，抑制病毒传播是一个课题。

巴斯德研究所表示，由于无法准确估算法国新型冠状病毒的来源和输入时间，多个国家的病毒采样工作还不完善。 西蒙·罗利说:“我们最初的注意表明，法国流行的新型冠状病毒感染与无症状病例有关。 对不同地区的新型冠状病毒进行测序非常重要，可以更好地了解法国新型冠状病毒的流行轨迹。 ”。